Le territoire de la commune de Sète peut être divisé ainsi :
l'étang de Thau.
le cordon littoral entre Sète et Marseillan avec sa longue plage, une route nationale et la voie ferrée Montpellier-Béziers, ainsi qu'un domaine viticole.
l'île singulière en elle-même : le mont Saint-Clair. En contrebas à l'est, la ville d'origine. Au nord, à l'ouest et sur les versants du mont, les quartiers résidentiels récents.
à l'est de la ville s'étendent les espaces portuaires de plaisance, de voyage et industriel.
relation particulière avec le canal du Midi par l'étang de Thau (dit canal des Deux-Mers) par Marseillan (Toulouse-Bordeaux), ainsi que la liaison par le canal du Rhône-Méditerranée étang de Thau/Frontignan Aigues-Mortes.